Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hmgn5Q9JL35 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hmgn5Q9JL35 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hmgn5Q9JL35 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgn5Q9JL35 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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