Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tuba8Q9JJZ2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tuba8Q9JJZ2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tuba8Q9JJZ2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Tuba8Q9JJZ2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tuba8Q9JJZ2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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