Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl28Q9JIL2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms