Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmod3Q9JHJ0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmod3Q9JHJ0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmod3Q9JHJ0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmod3Q9JHJ0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmod3Q9JHJ0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmod3Q9JHJ0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod3Q9JHJ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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