Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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