Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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