Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx6Q9ER75 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms