Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms