Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnft1Q9DCN7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnft1Q9DCN7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rnft1Q9DCN7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnft1Q9DCN7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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