Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hmgn3Q9DCB1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hmgn3Q9DCB1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hmgn3Q9DCB1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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