Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syde1Q9DBZ9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms