Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37427-201ENSMUST00000192356 906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms