Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smg9Q9DB90 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg9Q9DB90 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms