Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrmuQ9DAT5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms