Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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