Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Alkbh4Q9D8F1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Alkbh4Q9D8F1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Alkbh4Q9D8F1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Alkbh4Q9D8F1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Alkbh4Q9D8F1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Alkbh4Q9D8F1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms