Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn23Q9D7D7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn23Q9D7D7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn23Q9D7D7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn23Q9D7D7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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