Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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