Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccdc7Q9D541 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccdc7Q9D541 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc7Q9D541 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc7Q9D541 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc7Q9D541 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc7Q9D541 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc7Q9D541 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms