Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zc2hc1bQ9D534 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zc2hc1bQ9D534 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zc2hc1bQ9D534 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zc2hc1bQ9D534 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zc2hc1bQ9D534 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Zc2hc1bQ9D534 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Zc2hc1bQ9D534 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Zc2hc1bQ9D534 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Zc2hc1bQ9D534 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Zc2hc1bQ9D534 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Zc2hc1bQ9D534 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Zc2hc1bQ9D534 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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