Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syce1Q9D495 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syce1Q9D495 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms