Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lamp5Q9D387 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms