Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms