Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms