Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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