Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms