Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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