Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rprd1bQ9CSU0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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