Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms