Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms