Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl20Q9CQL4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl20Q9CQL4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms