Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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