Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms