Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubl4bQ9CQ84 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubl4bQ9CQ84 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms