Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rpa3Q9CQ71 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rpa3Q9CQ71 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpa3Q9CQ71 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpa3Q9CQ71 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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