Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms