Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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