Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms