Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms