Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sf3b1Q99NB9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b1Q99NB9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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