Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms