Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms