Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins4Q99LZ3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms