Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms