Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sh3bp5lQ99LH9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp5lQ99LH9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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