Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp16Q99LG0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms