Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms