Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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TrabdQ99JY4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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TrabdQ99JY4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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TrabdQ99JY4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TrabdQ99JY4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TrabdQ99JY4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrabdQ99JY4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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