Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pacsin3Q99JB8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms