Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctu1Q99J10 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ctu1Q99J10 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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